为搞好天津国际生物医药联合研究院的建设工作，经天津市机构编制委员会批准成立了天津市国际生物医药联合研究院，为专门从事科学研究的事业单位，所需人员经费由市财政全额拨付。
天津市国际生物医药联合研究院下设“两办六部”，各部门职责如下：
院长办公室：
负责联合研究院行政、文秘、人事、宣传、档案、与业务相关的软条件支撑等。
下挂：GMP办公室：大平台办公室。
综合办公室：
主要负责联合研究院后勤保障体系、安全、交通、车辆管理、网络管理等。
人才与技术部：
负责PI团队人才的联络、交流、服务和管理。各类人才计划推荐，包括千人计划、百人计划、领军人才、开发区领军人才等；研究院人才的评审、组织、考核和管理工作。
博士后工作站申报及管理，博士后管理。生物医药信息平台建设与管理，融资平台的建设与管理。
条件保障部：
负责新建及维修改造，维修、改造工程前期立项；工程项目招标事宜；现场监督管理；已有建筑设施的维修、定期保养和物业的沟通。
仪器设备、实验材料购置，与政采联系，仪器设备(实验室家具)标书编制、完成招标全部程序，审核督促合同实施；与海关、机电进口联系减免税手续、口岸报关；零星自采设备和实验材料。建立相关规章制度。大楼实验室管理、仪器设备管理、实验室安全、排污处理等。
国有资产管理，仪器、设备、家具，接收、验收、入账、审核、系统管理；各种凭单管理；仪器借出、收回、调拨、报废及处置，与财务对账，完成资产报表。探讨建立相关规章制度。
技术平台协调与实验室安全，对核心技术平台和支撑技术平台之间，以及PI团队与各技术平台之间的交叉需求进行协调，条件改善计划的编制；实验室安全相关制度的建立，化学危险品试剂、放射性物质购置前期的报批；废弃物处置；合同管理及技术档案（含部内综合事务）；分析测试平台的建设与管理。
下挂：国家实验室中心办。
项目管理部：
负责项目引进、过程管理、专项、合同签订等成果申报。入院项目的评估、验收、申请、审批、签约和项目成果专利的申报；入院团队公司的注册、项目产业化等一系列推进；新药发现平台的建设与管理。
研究生部：
负责来自各个高校的研究生生活管理；负责研究生思想教育管理和日常文体活动的组织与协调；负责研究生的教学保障（教室条件、课程安排、档案保管、教室接待等）；制定研究院研究生管理相关规章制度。对外负责与相关高校研究生管理部门沟通，协调有关事宜；负责与高校具体专业学院协调，合作教学和学位论文研究事宜。
账务部：
负责联合研究院财务统一管理、监督、审计等。
投资运行部：
负责联合研究院的投资运行和资本运作，搭建生物医药产业融资平台和技术交易平台，提供研发团队融资和公司上市等服务。