“高通量分子药物筛选平台”是一个高通量、自动化的以人类重大疾病靶标蛋白质结构为基础、以中药等天然产物混合物药物筛选为特色的分子药物筛选平台。该平台将提供一个国际上最先进的综合性分子药物研发环境。
药物筛选平台的主要目标是，经过两年的基本建设与运行后，建立起国际上最完备的、涵盖中药等天然产物混合物和常规化合物等备选库的药物研发体系。力争每年产生不少于100个能够与靶标蛋白分子结合的化合物(Hits), 从中优化出10个与靶标蛋白分子有较强结合能力、具有较好药学特性的药物先导化合物(Drug Leads)。通过对先导化合物的进一步优化和系统化的药物学评估，力争使其中的1至2个药物备选物（drug candidate）获得新药临床批文。
根据功能与职责，该平台划分为四个主要模块：泛分子药物备选库，靶标蛋白潜在分子药物筛选模块，先导化合物的验证与优化模块，计算机辅助药物设计及系统管理模块。利用包括蛋白质化学、细胞生物学、病毒学、蛋白质晶体学等多种高通量的药物筛选、设计与开发技术，以重大传染性疾病（包括HIV、病毒性肝炎、流感、结核病等）和人类重大疾病（肿瘤、癌症、心脑血管疾病等）为靶点，在高通量、自动化技术的支持下，从蛋白质、细胞和动物等筛选模型上，筛选得到对疾病具有较好治疗效果的药物前体或药物。